El Núcleo de Investigación en Estudios Interétnicos e Interculturales ha participado en la creación de dos programas de posgrado, un magíster y un doctorado en Estudios Interculturales, cuyos docentes son, en su mayoría, miembros del NEII. Varios de los investigadores e investigadoras del Núcleo participan también en otros programas de posgrado de la Facultad de Ciencias Sociales y Humanidades de la Universidad Católica de Temuco.